犯罪率超低并在世界范圍內享有盛名的和平之國東德魯阿，其本國歌手奎恩·馬爾塔（皆瀬 まりか 配音）在鄰國西德魯阿遭人暗殺。該事件使得東西兩國關系瞬時緊張，戰爭一觸即發。在此危急時刻，魯邦三世（栗田貫一 配音）和次元大介（小林清志 配音）潛入東德魯阿，伺機盜取傳世秘寶“里特爾彗星”。誰知行動中他們遭遇警察埋伏，逃跑中一個黑影突然閃現，開槍襲擊次元。次元敏銳地發現，襲擊他的人很可能與殺害馬爾塔的是同一人。在此之后，魯邦與次元來到墓地，結果竟然在那里見到了一塊刻有次元大介名字的墓碑。據說江湖上有一個傳奇刺客奧崎耶魯（廣瀨彰勇 配音），他會提前為其準備刺殺的人立上一塊墓碑，凡是名字上了墓碑的人沒有一個能逃過他的刺殺，但次元深感奧崎背后另有主使。與此同時，峰不二子（澤城美雪 配音）潛入某個秘密俱樂部，結果被俱樂部所有者抓獲。未過多久，魯邦和次元循著蛛絲馬跡終于來到一處神秘所在，卻在那里看到被囚禁起來的不二子。而就在此時，奧崎出現在他們面前……